Algum tempo depois do desembarque em terras brasileiras, os jesuítas perceberam que a fundação de escolas era a melhor maneira de formar novos sacerdotes para auxiliar os missionários no trabalho de catequese dos indígenas. O encarregado dessa tarefa foi o padre Manuel da Nóbrega, e, em 1550, foram inaugurados dois colégios: um na Bahia e outro em São Vicente – este deu origem à cidade de São Paulo.
Bahia, 9 de agosto de 1549
Ao padre mestre Simão,
A graça e amor de Nosso Senhor Jesus Cristo seja sempre em nosso favor. Amém.
Pela primeira via escrevi a vossa reverendíssima e aos irmãos largo, e agora tornarei a repetir algumas coisas, ao menos em soma, porque o portador desta, como testemunha de vista, me escusará de me alargar muito, […]